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基本遗传概率的计算

单基因遗传疾病的可能性

常染色体显性遗传病（AD）：如果父母一方生病，孩子生病的几率是1/2。；如果双方都生病了，孩子生病的几率是3/4。

常染色体隐性遗传病（AR）：如果父母都是杂合子携带者，孩子生病的几率是1/4。

X连锁显性遗传病：男性病人的女儿必须生病，女性病人的儿子有一半可能生病。

X连锁隐性遗传病：男性病人的母亲和女儿必须是携带者或病人，女性病人的父母至少有一方是病人或携带者。

分离定律和独立分配定律的应用

分离规律：在形成配子时，一对等位基因相互分离，进入不同的配子。

独立分配定律：非等位基因在非同源染色体上的遗传是独立的，它们在形成配子时可以自由组合。

遗传距离和连锁分析

计算遗传距离

利用重组率估算两个基因之间的遗传距离，摩尔根是常用单位的中心。（cM）。

具体计算可以采用Haldane公式、Sturtevant公式等方法。

哈迪-温伯格连锁不平衡

连锁不平衡是指基因频率不符合独立分配的预期。

哈迪-温伯格平衡是指一个大型、随机交配的种群的基因频率和基因频率在理想条件下(无突变、迁移和自然选择)在代代相传中是稳定的。

估计群体遗传学参数

计算基因频率和基因频率

基因频率=某个等位基因/(总等位基因)

基因频率=基因型个体数/总个体数

多态度的遗传度量

杂合度（H）、多态化信息含量（PIC）用于评估遗传变异程度的指标。

有效的群体大小（Ne）的估算

实际参与繁殖的有效个体数量是通过观察遗传漂变对基因频率的影响来计算的。

分子遗传学方法

DNA序列分析

用于直接测量DNA序列，包括PCR扩增、测序技术(如Sanger测序、高通量测序)等。

多态性限制片段长度（RFLP）

利用限制性内切酶切割DNA产生不同长度的片段来分析多态性。

多态性单核苷酸（SNP）分析

在相关研究、药物基因组学等领域，检测基因组中单个核苷酸的差异。

进化遗传方法

构建系统发育树

利用邻接法、最大似然法等算法，基于DNA或蛋白质序列的相似性，构建物种之间的进化关系树。

分子钟理论

通过比较不同物种之间相同基因的序列差异来计算其分化时间。

中性化进化理论

Kimura提出的理论认为，大多数突变是中性的，对生物的适应性没有直接影响，但可以通过遗传漂移固定在种群中。